RISTEXは、社会技術研究開発の実施及び研究開発にかかわる業務について、センター長を中心に以下のような体制で推進しています。
社会技術研究開発主監会議
有識者およびプログラムディレクター（センター長）により構成され、研究開発領域・プログラムの設定および改廃に関することなど、RISTEXの運営にかかわる重要事項について審議します。
運営評価委員会
有識者により構成され、研究開発領域・プログラムの目標達成・進捗状況等について、中間評価、事後評価を実施します。
企画運営室
企画運営室長のもと、研究開発領域・プログラムの設定・運営・管理、研究開発にかかわる各種支援、企画、広報活動などに関する業務を推進しています。また、社会問題の構造・重要度や新技術の社会実装に伴い想定される課題（ELSI）についての調査研究活動なども行っています。
ファンディングによる研究開発
研究開発領域・プログラムを設定して研究開発を推進しています。それぞれ領域・プログラム総括のもと、アドバイザーやRISTEXスタッフが連携して領域・プログラムを運営します。研究開発プロジェクトの募集・選考・運営・管理等に加え、プロジェクト連携の促進やアウトリーチ活動、横断的な知見創出など、領域・プログラムレベルでの成果創出を行っています。
- ELSIへの取り組みとして、2018年度より開始した「人と情報のエコシステム」研究開発領域に加え、2020年度には、エマージング・テクノロジーにおけるELSI研究と方法論開発、多様なELSI人材の養成を狙いとする「科学技術の倫理的・法制度的・社会的課題（ELSI）への包括的実践研究開発プログラム」を開始
- 社会課題解決に向けた取り組みとして、2019年度より開始した「SDGsの達成に向けた共創的研究開発プログラム（SOLVE for SDGs）」に加え、2021年度には社会的孤立の予防に関するプログラム、2023年度には情報社会における社会的側面からのトラスト形成に関するプログラムを開始
社会技術研究開発主監
五十音順敬称略
| 小野 由理 | 株式会社三菱総合研究所デジタルトランスフォーメーション部門 参与 |
|---|---|
| 清水 肇子 | 公益財団法人さわやか福祉財団 理事長 |
| 丸谷 浩明 | 東北大学災害科学国際研究所 副研究所長・教授 |
運営評価委員
五十音順敬称略
※：委員長
| 神尾 陽子 | 神尾陽子クリニック 院長 |
|---|---|
| 神里 達博 | 千葉大学大学院国際学術研究院 教授 |
| 高橋 真理子 | ジャーナリスト |
| 谷口 真人 | 総合地球環境学研究所 研究基盤国際センター 教授 |
| 仲 真紀子 | 理化学研究所 理事 |
| 中村 安秀 | 公益社団法人日本WHO協会 理事長 |
| 林 隆之 ※ | 政策研究大学院大学 教授 |
| 菱山 豊 | 順天堂大学革新的医療技術開発研究センター 特任教授 |
（令和6年4月現在）
