本研究領域は創薬・診断・予防といった医療応用を見据え、生体内化合物の動態解析を出発点とした、疾患を反映する代謝産物等の探索およびその情報に基づく標的分子の分析を加速する技術の創出を目的とします。

　具体的には、新規疾患関連因子の発見につながる超高感度検出技術、見出された因子の同定技術・定量計測技術、そしてこれらのスループットを飛躍的に高める技術や多種因子同時分析技術、各種情報技術等を開発します。また、既知の生理活性化合物が作用する代謝産物やタンパク質、代謝経路の特定を通じて、医療応用につなげるための標的分子を解析する一連の技術群の開発・高度化もあわせて行います。これらの成果により技術的アプローチを多様化し、医療応用を目指す上で標的となりうる生体内分子を核としたヒト疾患制御の概念実証に貢献します。

　本研究領域ではナノテクノロジー、合成化学、工学等の分野とライフサイエンスの融合研究を積極的に支援し、イノベーションの源泉を涵養します。また、日本医療研究開発機構(AMED)のCREST「疾患における代謝産物の解析および代謝制御に基づく革新的医療基盤技術の創出」研究領域（以下「AMED-CREST疾患代謝」と表記。）とは緊密に連携して運営します。そのため、独立した研究者として各研究課題を担うさきがけ研究者には、AMED-CREST 疾患代謝と有機的なつながりを持ったバーチャル・ネットワーク型研究所の一員としての活躍にも強く期待します。