植田 美那子

生命情報の低次元化を起点とする多階層モデル駆動型研究戦略の創出

研究代表者

植田 美那子

主たる共同研究者

研究概要

高次元かつ多階層の生命システムは複雑であり、「どの遺伝子が、どの事象を制御し、どのルールに寄与するか」という分子機構の全容を解明することは至難です。本研究では、生命システム自体を低次元化した定量数理モデル（多階層モデル）を構築し、そこにオミクス解析やイメージング解析から得た実体情報も低次元化して導入することで、生命システムを包括的に理解するという新たな方法論の開発を目指します。

岡本 康司

マルチオミクス１細胞解析による難治がん組織空間の数理的再構成

研究代表者

岡本 康司

主たる共同研究者

研究概要

臨床がんの治療抵抗性は、がん細胞と様々な非がん細胞が構成する複雑な相互依存ネットワークに関与していることが知られています。本研究では、臨床がんやマウス移植腫瘍モデルを対象とし、最新の１細胞解析技術・空間的発現解析テクノロジーと先端的な数理的解析法を組合わせた研究により、治療抵抗性を担う細胞相互作用を空間的に可視化し、がんの難治性を担う細胞ネットワークの本態を明らかにすることを目指します。

黒田 真也

時空間トランスオミクスを用いた多細胞・臓器連関代謝制御の解明

研究代表者

黒田 真也

主たる共同研究者

研究概要

哺乳類の全身の代謝恒常性は、分子レベルではDNA・RNA・タンパク質・代謝物の各オミクス階層にまたがるトランスオミクスネットワークにより、細胞レベルでは代謝細胞が臓器内で最適な空間的配置（ゾネーション）により、臓器レベルでは内分泌系と自律神経系のクロストークにより制御されています。本研究では分子レベル・細胞レベル・臓器レベルを時空間トランスオミクスにより統合し、代謝恒常性のメカニズムを解明します。

新宅 博文

RNA movieによる多細胞運命分岐のダイナミクスアノテーション

研究代表者

新宅 博文

主たる共同研究者

研究概要

従来のオミクス解析の多くは、計測のために対象の細胞や組織の生命活動を中断させる必要がありました。本研究では、ナノ電場を利用した低侵襲分子サンプリング技術、それに基づくオミクス動画(RNA movie)撮影技術を開発し、転写制御ネットワークを動画で理解する枠組みを構築します。そして、RNA movieを通して、疾患・発生機構における重要な運命分岐ダイナミクスに関する理解の深化を目指します。