「独創的シーズ展開事業　独創モデル化」
平成１８年度採択課題　事後評価報告書

平成１９年１０月

独立行政法人科学技術振興機構

６．

評価対象課題の個別評価

　３高解像度遺伝子発現解析法(HiCEP)による多検体比較解析システムの開発

企業名	：メッセンジャー・スケープ株式会社
研究者（研究機関名）	：齋藤　俊行（放射線医学総合研究所　先端遺伝子発現研究センター）

１）

モデル化の概要および成果

　疾患の早期診断や個別化医療実現のためには多様なバイオマーカーが必要であるが、細胞内mRNA発現情報の解析に、網羅性・再現性・信頼性に優れた遺伝子発現解析技術HiCEPを利用すれば、マーカー遺伝子開発の促進が期待できる。

本モデル化では、多検体からのHiCEP測定データを統計処理、データマイニングし、マーカー候補転写物を抽出出来るソフトウエアを開発することにより、既存のDNAマイクロアレイ等では実現出来なかった高い測定精度・信頼性で、かつ迅速にマーカー候補転写物をスクリーニングする遺伝子マーカー探索システムの構築を行った。

その結果、HiCEP法で得られるピークデータ、波形間距離データを使用し、有意な変動ピークの抽出、癌－非癌といった試料の分類、試料属性の判定を効率的かつ合理的に行うことが出来るマーカー探索が可能になった。

２）

事後評価

	モデル化目標の達成度　HiCEP測定データから計算されたマーカーピークデータを使用した分類アルゴリズムでは目標を達成したが、同じく波形距離データを使用したアルゴリズムでは、解析対象の個体間での発現変動が大きい場合に、目標を達成出来ていない。全体として基本的な部分は所期の目標はほぼ達成されている。
	知的財産権等の発生　特許出願の準備中である。
	企業化開発の可能性　既に試作ソフトウエアを用いて、従来法では診断困難なアルツハイマー病分野等への探索研究を専門の臨床医と協力しながら進めており、企業化の可能性が期待される。
	新産業及び新事業創出の期待度　本手法の高精度化が確立されれば、新産業創出が期待できる。また、社会的意義も認められる。

３）

評価のまとめ

　遺伝子発現解析技術HiCEPから得られた高精度な発現量データを多検体で解析できるソフトウエアを試作し、目標を概ね達成して各分野への期待値は大きいが、個体差問題など克服すべき課題も明らかとなり、今後の更なる改良を期待する。

今回新たに見出された波形間距離に基づくデータマイニング手法は、波形パターン自体を「バイオマーカー」として活用するものであり、他に類似手法のない独自性の高いものであるため、実用化時の波及効果は大きいと思われる。

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