クロマチン構造研究グループChromatin structure research group

胡桃坂 仁志 Hitoshi Kurumizaka

研究総括Research Director
胡桃坂 仁志Hitoshi Kurumizaka


The diversity of higher-order structures of chromatin, which regulates genetic information regardless of the DNA sequences, is considered to be the basis of “epigenetics”. By employing principally cryo-electron microscopy technology, we aim to reveal the correlation between the diversity of chromatin structures and its function, which will facilitate efforts to elucidate the mechanisms of epigenetics controlling the fundamental phenomenon of gene regulation.

1995 埼玉大学大学院理工学研究科 博士(学術)
Ph.D., Graduate School of Science and Engineering, Saitama University
1995 – 1997 National Institutes of Health 博士研究員
Postdoctoral fellow, National Institutes of Health, USA
1997 – 2003 理化学研究所 研究員
Research Scientist, RIKEN Institute
2003 – 2018 早稲田大学理工学術院 助教授、准教授、教授
Associate Professor, Professor, Faculty of Science and Engineering, Waseda University
2018 – 東京大学定量生命科学研究所 教授
Professor, Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo
2019 – JST ERATO 研究総括
JST ERATO Research Director

滝沢 由政 Yoshimasa Takizawa

研究総括補佐Project Coordinator
滝沢 由政Yoshimasa Takizawa


Currently, the cryo-electron microscope technology is the most powerful tool for studying structural biology. My objective is to determine various three-dimensional structures of chromatin using the cryo-EM method to understand the diversity of the chromatin structures and its functions.

2006 横浜市立大学大学院総合理学研究科 博士(理学)
Ph.D., Graduate School of Science, Yokohama City University
2006 – 2009 早稲田大学理工学部 助手、助教
Research Assistant, Assistant Professor, Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University
2009 – 2014 Vanderbilt University 博士研究員、スタッフサイエンティスト
Postdoctoral Fellow, Staff Scientist, Vanderbilt University, USA
2014 – 2018 沖縄科学技術大学院大学 スタッフサイエンティスト
Staff Scientist, Okinawa Institute of Science and Technology (OIST)
2018 – 東京大学定量生命科学研究所 助教、准教授
Research Assistant Professor, Associate Professor, Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo
2019 – JST ERATO 研究総括補佐
JST ERATO Project Coordinator

東京大学定量生命科学研究所 Institute for Quantitative Biosciences

  • 堀越 直樹 / Naoki Horikoshi 研究員 / Researcher
  • 野澤 佳世 / Kayo Nozawa 研究員 / Researcher
  • 鯨井 智也 / Tomoya Kujirai 研究員 / Researcher
  • 松本 翔太 / Syota Matsumoto 研究員 / Researcher
  • 佐藤 祥子 / Shoko Sato 研究員 / Researcher
  • 田中 大貴 / Hiroki Tanaka 研究員 / Researcher
  • 西村 正宏 / Masahiro Nishimura 研究員 / Researcher
  • 平野 里奈 / Rina Hirano 研究員 / Researcher
  • 武田 泰子 / Yasuko Takeda 技術員 / Technician
  • 根岸 瑠美 / Lumi Negishi 技術員 / Technician
  • 小林 由紀 / Yuki Kobayashi 技術員 / Technician
  • 大角 健 / Ken Osumi 研究協力員 / D4
  • 畠澤 卓 / Suguru Hatazawa 研究協力員 / D4
  • 何 承翰 / Cheng-han Ho 研究協力員 / D2
  • 陳 之慧 / Zhihui Chen 研究協力員 / D2
  • 越後谷 健太 / Kenta Echigoya Research Assistant / D2
  • 平井 誠也 / Seiya Hirai 研究協力員 / D2
  • 赤津 綜隆 / Munetaka Akatsu  研究協力員 / D1
  • 福島 友太郎 / Yutaro Fukushima  研究協力員 / D1
  • 大井 茉祐子 / Mayuko Oi 研究協力員 / M2
  • 大畑 健太 / Kenta Ohata 研究協力員 / M2
  • 塩井 琢郎 / Takuro Shioi 研究協力員 / M2
  • 須賀 遼 / Ryo Suka 研究協力員 / M2
  • 野澤 朋矢 / Tomoya Nozawa 研究協力員 / M2
  • 前野 早良 / Sarara Maeno 研究協力員 / M2
  • 大石 匠美 / Takumi Oishi 研究協力員 / M1
  • 木村 友昭 / Tomoaki Kimura 研究協力員 / M1
  • 許 文杰 / Wenjie Xu 研究協力員 / M1
  • 三宅 諒祐 / Ryosuke Miyake 研究協力員 / M1
  • 山本 京香 / Kyoka Yamamoto 研究協力員 / M1
  • ダッシェ マリコ / Mariko Dacher 研究推進主任 / Research Manager
  • 飯倉 ゆかり / Yukari Iikura 研究推進主任 / Administrative Manager
  • 深谷 佑紀 / Yuki Fukaya 研究推進員 / Administrative Staff
  • 小笠原 光雄 / Mitsuo Ogasawara 研究推進員 / Administrative Staff
  • 小林 憲子 / Noriko Kobayashi 研究推進員 / Administrative Staff

東京大学大学院医学系研究科 Graduate School of Medicine, The University of Tokyo

  • 吉川 雅英 / Masahide Kikkawa 研究員 / Researcher
  • 福田 善之 / Yoshiyuki Fukuda 研究員 / Researcher
  • 佐々木 諒平 / Ryohei Sasaki 研究協力員 / D3

東京工業大学理学院物理学系 Department of physics, Tokyo Institute of Technology

  • 藤芳 暁 / Satoru Fujiyoshi 研究員 / Researcher
  • 成瀬 寛太 / Kanta Naruse 研究協力員 / D1
  • 湯本 達也 / Tatsuya Yumoto 研究協力員 / M2
  • 神谷 直輝 / Naoki Kamiya 研究協力員 / M2
  • 荒巻 秀和 / Hidekazu Aramaki 研究協力員 / M2
  • 藏本 和輝 / Kazuki Kuramoto 研究協力員 / M1
  • 頼田 拓真 / Takuma Yorita 研究協力員 / M1
  • 坂本 大起 / Daiki Sakamoto 研究協力員 / B4
  • 佐藤 響 / Hibiki Satoh 研究協力員 / B4

有機合成化学研究開発グループOrganic synthesis chemistry research and development group

山口 潤一郎 Junichiro Yamaguchi

グループリーダーGroup Leader
山口 潤一郎Junichiro Yamaguchi


A molecule—which is the smallest fundamental unit of matter that exhibits the properties of the substance—can be structurally combined in an infinite number of ways. Building a multitude of such molecules while exploring new chemical space is not only “fun” but also opens up “new possibilities” to serve the chemical, as well as the global community. The discipline that can realize the creation of new molecules is synthetic chemistry. In order to contribute to the continued development of synthetic chemistry, our research goals are three-fold: building molecules/destroying molecules/creating game-changing molecules. To tackle these fundamental pursuits in synthetic chemistry, we aim to become masters in the art of molecular construction by using unique synthetic strategies and catalyst designs.

2007 東京理科大学大学院工学研究科 博士(工学)
Ph.D. Graduate School of Engineering, Tokyo University of Science
2007 – 2008 The Scripps Research Institute 博士研究員
Postdoctoral fellow, The Scripps Research Institute, USA
2008 – 2016 名古屋大学大学院理学研究科 助教、准教授
Assistant Professor, Associate Professor, Graduate School of Science, Nagoya University
2016 – 早稲田大学理工学術院 准教授、教授
Associate Professor, Professor, Faculty of Science and Engineering, Waseda University
2019 – JST ERATO 研究グループリーダー
JST ERATO Research Group Leader

早稲田大学理工学術院 Faculty of Science and Engineering, Waseda University

  • 武藤 慶 / Kei Muto 研究員 / Researcher
  • 太田 英介 / Eisuke Ota 研究員 / Researcher
  • 加藤 健太 / Kenta Kato 研究員 / Researcher
  • 齊藤 杏実 / Ami Saito 研究協力員 / D3
  • 黒澤 美樹 / Miki Kurosawa 研究協力員 / D2
  • 坂井 祐衣 / Yui Sakai 研究協力員 / M2
  • 宮﨑 龍也 / Tatsuya Miyazaki 研究協力員 / M2

表現型解析研究グループPhenotype analysis research group

岡田 由紀 Yuki Okada

グループリーダーGroup Leader
岡田 由紀Yuki Okada


We are investigating chromatin dynamics during germ cell differentiation and development. Our particular interest is sperm-retained histones, and we are trying to elucidate the mechanisms how they are escaped from histone-protamine exchange and whether they have transgenerational effects.

2002 北海道大学大学院獣医学研究科獣医学専攻(獣医学博士)
Ph.D., Veterinary Medicine, Hokkaido University
2002-2004 北海道大学大学院医学研究科 博士研究員
Postdoctoral fellow, Department of Medicine, Hokkaido University
2004 – 2007 University of North Carolina at Chapel Hill 博士研究員
Postdoctoral fellow, University of North Carolina at Chapel Hill, USA
2007 – 2009 University of North Carolina at Chapel Hill/Howard Hughes Medical Institute 博士研究員/ リサーチスペシャリスト
Postdoctoral fellow/Research Specialist, University of North Carolina at Chapel Hill/Howard Hughes Medical Institute, USA
2009 – 2012 京都大学生命科学系キャリアパス形成ユニット 特定助教
Specially appointed Assistant Professor, Career-Path Promotion Unit for Young Life Scientist, Kyoto University
2012 – 2018 東京大学分子細胞生物学研究所 特任准教授、准教授
Tenure-Track Associate Professor, Associate professor, Institute of Molecular and Cellular Biosciences, The University of Tokyo
2018 – 東京大学定量生命科学研究所 准教授、教授
Associate Professor, Professor, Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo
2019 – JST ERATO 研究グループリーダー
JST ERATO Research Group Leader

東京大学定量生命科学研究所 Institute for Quantitative Biosciences

  • 藤原 靖浩 / Yasuhiro Fujiwara 研究員 / Researcher
  • 羽田 政司 / Masashi Hada 研究員 / Researcher
  • 名古 由佳 / Yuka Nago 研究員 / Researcher
  • 福田 裕子 / Yuko Fukuda 技術員 / Technician
  • 井上 絵里奈 / Erina Inoue 技術員 / Technician
  • 吉開 清人 / Kiyohito Yoshikai 研究協力員 / Animal Technician
  • 古賀 千津子 / Chizuko Koga 技術員 / Technician
  • 李 鉴汐 / Jianxi Li 研究協力員 / M1
  • 姚 品碩 / Pinshuo Yao 研究協力員 / M1