日本を含め、以下の１２ヵ国１３機関がＥＩＧ ＣＯＮＣＥＲＴ－Ｊａｐａｎに主なメンバーとして参加しています。
| 参加国 | 研究助成機関名 |
|---|---|
| 日本 | 科学技術振興機構（ＪＳＴ） |
| スペイン | スペイン国家研究機構（ＡＥＩ） |
| スロバキア | スロバキア科学アカデミー（ＳＡＳ） |
| チェコ | チェコ科学アカデミー（ＣＡＳ） |
| チェコ | チェコ教育青年スポーツ省（ＭＥＹＳ） |
| ドイツ | ドイツ連邦教育研究省（ＢＭＢＦ） |
| トルコ | トルコ科学技術研究会議（ＴÜＢİＴＡＫ） |
| ノルウェー | ノルウェー研究委員会（ＲＣＮ） |
| ハンガリー | 地域情報科学開発センター（ＲＣＩＳＤ） |
| フランス | フランス国立科学研究センター（ＣＮＲＳ）（事務局） |
| ブルガリア | ブルガリア国立科学基金（ＢＮＳＦ） |
| ポーランド | ポーランド国立研究開発センター（ＮＣＢＲ） |
| リトアニア | リトアニア科学技術革新機構（ＭＩＴＡ） |