微生物ロドプシンを「共通番号」で読み解く

東京大学 先端科学技術研究センターの但馬 聖也 特任研究員、加藤 英明 教授、同大学 大学院総合文化研究科の岸 孝一郎 大学院生（研究当時）、Paul Scherrer Institute（ポール・シェラー研究所）のFlurin S. Hidber（フルリン・S・ヒドベル） 氏、Xavier Deupi（シャビエ・デウピ） 氏らの国際研究グループは、微生物ロドプシンのアミノ酸残基を、たんぱく質ごとの配列番号に依存せず共通に示す「MOナンバリングシステム」を開発しました。

たんぱく質ごとに異なる配列番号は、研究成果の比較を難しくしていました。研究グループは、69件の実験構造と構造予測ツールBoltz-1による60件の予測構造から共通の基準位置を定め、約4万件の配列解析と代表構造の検証を通じて、機能未知群にも適用できることを示しました。異なるロドプシンの知見を同じ番号で結び付けることで、機能の理解や光遺伝学（オプトジェネティクス）ツールの設計が進むと期待されます。

本研究成果は、2026年11月5日（現地時間）付で、科学誌「npj Structural Biology」に掲載されました。