遺伝子発現の形から種間遺伝子対応を推測

京都大学 高等研究院 ヒト生物学高等研究拠点（WPI-ASHBi）の平岡 裕章 副拠点長／主任研究者、同 德田 有矢 特定研究員、同 井元 佑介 特定准教授らの研究グループは、異なる動物種の遺伝子発現データから、似た役割を担う遺伝子の候補を探す解析手法「Species-OT」を開発しました。

動物実験の知見をヒトの理解に生かすには、種を超えた遺伝子の働きの対応を調べる必要があります。しかし、DNA配列の類似性だけで、その対応が決まるとは限りません。本手法は、多数の遺伝子の発現パターンがつくる「形」を比較することで、種間の遺伝子対応候補を推定し、データ全体の違いを定量化します。さらに本手法をマウス・カニクイザル・ヒトの細胞分化過程と6種の哺乳類の多能性幹細胞データに適用し、既知の生物学的知見に整合する遺伝子対応を上位候補として捉えることに成功しました。

Species-OTは、種間で共通する仕組みと異なる仕組みを、実験で調べるための手がかりを提供します。

本成果は、2026年10月29日（日本時間）に、学術誌「Cell Reports Methods」にオンライン掲載されました。