理化学研究所（理研） 生命医科学研究センター 生命医科学大容量データ技術研究チームの信定 知江 研究員、粕川 雄也 チームリーダー、東京都医学総合研究所 ゲノム医学研究センターの川路 英哉 副センター長らの共同研究グループは、国際共同研究「ＦＡＮＴＯＭ（Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ＡＮｎｏＴａｔｉｏｎ ｏｆ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｇｅｎｏｍｅ）プロジェクト」の成果を基に、ＦＡＮＴＯＭウェブリソースにおけるゲノム上のノンコーディングＲＮＡ（ｎｃＲＮＡ）の機能情報の拡張と、シスエレメントに関する新たなデータベースを公開しました。
本研究成果は、遺伝子発現制御機構をはじめとする基礎研究に加え、疾患、薬などを対象とした生命科学分野の研究への活用が期待されます。
今回のＦＡＮＴＯＭウェブリソースの更新では、（１）ｉＰＳ細胞における長鎖ｎｃＲＮＡの機能情報、（２）クロマチン相互作用による核内長鎖ｎｃＲＮＡの機能情報、（３）今回新たに同定した転写活性に関わるゲノム領域であるシスエレメントの情報、について拡充されました。
本研究は、科学雑誌「Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ」（２０２５年データベース特集号）の掲載に先立ち、オンライン版（２０２４年１１月２７日付）に掲載されます。
本研究は、科学技術振興機構（ＪＳＴ） 統合化推進プログラム「統合的な転写制御データ基盤の構築（研究代表者：粕川 雄也、ＪＰＭＪＮＤ２２０２）」、日本医療研究開発機構（ＡＭＥＤ）ゲノム創薬基盤推進研究事業「ＲＮＡ標的医薬創出に資する、疾患ＲＮＡ分子完全長一次構造に関するデータ基盤の構築（研究代表者：川路 英哉、２３ｋｋ０３０５０２４）」、同 ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム「先天的／後天的構造多型に着目した免疫／精神疾患病態解明に関する研究開発（研究開発代表者：寺尾 知可史、２１ｔｍ０４２４２２０）」「炎症性関節炎の統合ゲノミクス解析（研究開発代表者：寺尾 知可史、２３ｔｍ０４２４２２５）」、同 免疫アレルギー疾患実用化研究事業「先天的・後天的ゲノム情報と臨床情報を用いた関節リウマチの層別化基盤の構築（研究開発代表者：寺尾 知可史、２３ｅｋ０４１０１１４）」による助成を受けて行われました。
＜プレスリリース資料＞
- 本文 ＰＤＦ（４９２ＫＢ）
＜論文タイトル＞
- “Update of the FANTOM web resource: enhancement for studying noncoding genomes”
- ＤＯＩ：10.1093/nar/gkae1047
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