東京大学,科学技術振興機構(JST)

令和6年11月19日

東京大学
科学技術振興機構(JST)

細胞外小胞の放出制御因子を網羅的に解析する方法を開発

~CRISPR gRNAで「バーコード化」した細胞外小胞を活用して~

ポイント

東京大学 大学院医学系研究科の小嶋 良輔 准教授、國武 厚貴 特任研究員(研究当時:東京大学 大学院薬学系研究科 大学院生)、東京大学 大学院薬学系研究科の水野 忠快 助教、浦野 泰照 教授(東京大学 大学院医学系研究科 兼担)らによる研究グループは、小型の細胞外小胞(small Extracellular Vesicles、sEV)の放出を制御する因子を網羅的に解析する新手法、CIBER screening法を開発しました。本研究では、細胞内で遺伝子のノックアウト(KO)に用いるCRIPSR/Cas9システムのガイドRNA(gRNA)を、sEV内に核酸バーコードとして封入する手法を開発し、このバーコード配列を次世代シークエンサーによって一斉解析することで、sEVの放出制御因子の網羅的な探索を実現しました。本手法を用いて、sEVの放出制御因子を多数発見するとともに、これまで不明な点が多かった、異なるsEVの亜集団に特異的な放出制御因子を見いだすことにも成功しました。

本研究成果は、2024年11月19日(英国時間)に「Nature Communications」に掲載されます。

本研究は、JST 創発的研究支援事業(課題番号:JPMJFR214N)、同 戦略的創造研究推進事業 さきがけ(課題番号:JPMJPR17H5)、同 戦略的創造研究推進事業 CREST(課題番号:JPMJCR19H1、JPMJCR23B7)、Human Frontier Science Program(課題番号:CDA-00008/2019-C)、科研費 学術変革B(課題番号:24H00868)、新世代研究所 ATI研究助成の支援により実施されました。

<プレスリリース資料>

<論文タイトル>

“Barcoding of small extracellular vesicles with CRISPR-gRNA enables comprehensive, subpopulation-specific analysis of their biogenesis/release regulators”
DOI:10.1038/s41467-024-53736-x

<お問い合わせ先>

(英文)“Labeling cell particles with barcodes New CRISPR-based system could help us better understand cell-to-cell communication with unprecedented efficiency”

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