ポイント
- 1分子量子シークエンサーで、マイクロRNAの塩基配列決定と化学修飾解析を実現
- 化学修飾間の干渉効果を発見
- マイクロRNAによる難治性消化器がんの早期診断への応用に期待
大阪大学 産業科学研究所の谷口 正輝 教授、鷲尾 隆 教授と大阪大学 大学院医学系研究科の石井 秀始 特任教授(常勤)らの研究グループは、1分子量子シークエンサーを用いて、転移性大腸がんなどの難治性消化器がんのマーカーであるマイクロRNAで2種類の化学修飾を直接同時検出することに成功しました。
マイクロRNAの化学修飾は、がんのマーカーになることが知られています。しかし、マイクロRNAの塩基配列と化学修飾を同時に調べる方法がなく、マイクロRNAを用いたがん早期診断法の開発の大きなハードルとなっていました。
今回、本研究グループは、トンネル電流で1分子を識別する1分子量子シークエンサーを用いて、難治性消化器がんの細胞から採取したマイクロRNAの塩基配列と化学修飾を調べたところ、マイクロRNAに化学修飾されたアデニンとシトシンの2種類の直接同時検出に世界で初めて成功しました。これにより、化学修飾されたマイクロRNAの機能解明と、難治性消化器がんの早期診断法の開発が期待されます。
本研究成果は、英国科学誌「Scientific Reports」に、2021年とは9月29日(水)(日本時間)に公開されます。
本研究は、文部科学省科学研究費補助金と、科学技術振興機構(JST) 戦略的創造研究推進事業 CREST/機械学習と最先端計測技術の融合深化による新たな計測・解析手法の展開に関する研究の一環として行われました。
<プレスリリース資料>
- 本文 PDF(374KB)
<論文タイトル>
- “Single-Molecule RNA Sequencing for Simultaneous Detection of m6A and 5mC”
- DOI:10.1038/s41598-021-98805-z
<お問い合わせ先>
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石井 秀始(イシイ ヒデシ)
大阪大学 大学院医学系研究科 特任教授(常勤)
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