ＮＭＲ法によるたんぱく質構造の精度評価法を開発

理化学研究所（理研） 革新知能統合研究センター 分子情報科学チームのアドナン・スリオカ　研究員らの国際共同研究チームは、核磁気共鳴（ＮＭＲ）法に情報・数理科学の手法を適用することで、推定されたたんぱく質構造の精度を評価する「Ａｃｃｕｒａｃｙ ｏｆ ＮＭＲ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ Ｕｓｉｎｇ Ｒａｎｄｏｍ ｃｏｉｌ ｉｎｄｅｘ ａｎｄ Ｒｉｇｉｄｉｔｙ：ＡＮＳＵＲＲ法」を開発しました。

本研究成果は、創薬ターゲットとなるたんぱく質の構造決定のプロセスを加速し、疾病の新たな治療法などの開発に貢献すると期待できます。

Ｘ線結晶解析法では推定されたたんぱく質構造の精度評価法が確立しているのに対し、ＮＭＲ法では試料を結晶化しなくても細胞内の状況に近い溶液中でたんぱく質構造を推定できるという利点がありながら、これまで精度評価の有効な方法がなく、その応用が制限されてきました。

今回、国際共同研究チームは、ＮＭＲ法によって得られる情報のうち、これまで構造決定には使用されていなかった「化学シフト」から得られるランダムコイル指標と、「数理剛性理論」から得られる指標（構造柔軟性）を比較することで、推定されたたんぱく質構造の精度を評価することに成功しました。

本研究成果は、オンライン科学雑誌「Ｎａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ」（２０２０年１２月１８日付）に掲載されます。