NBDCは、ライフサイエンス分野のデータベースを統合し、データの価値を最大化することにより、日本のユーザー、さらには世界のユーザーに貢献できる、日本が誇るべきデータベースセンターとなることを目指し、「戦略の立案」、「ポータルサイトの構築・運用」、「データベース統合化基盤技術の研究開発」、「バイオ関連データベース統合化の推進」の4つを活動の柱とします。