バイオテクノロジーは、国の総合科学技術会議の定めた４重点研究開発分野の一分野であり、生命科学産業は、横浜市が今後積極的にベンチャー集積や産業クラスター形成を推進していく重要目標である。バイオの分野は、ゲノムからプロテオームの世代に入り、プロテオミクスの研究開発が、国際的に熾烈な競争裡に急速に進展している。
　横浜市には、タンパク質の構造解析、機能解析や相互作用解析などの分野で、夫々特徴ある機能をターゲットとして先端的研究を推進している大学、研究機関や関心の深い企業研究所も多い。これらを結集して、研究開発ネットワークを形成し、低分子化合物とタンパク質との相互作用の解析、機能性タンパク質の同定を柱とした新技術の開発を達成目標とし、創薬・機能性食品開発の基盤技術として優位性の高い機能性タンパク質の解析評価システムを確立する。
　同時に、この研究開発事業の発展段階に応じて、必要な、或いは関心のある研究者や中小企業を含む企業に共同研究の輪を広げ、地域ＣＯＥの構築を目指す。

　研究テーマの概要は以下のとおりである。