科学技術振興機構 さきがけ エピジェネティクスの制御と生命機能 エピジェネティクスの制御と生命機能さきがけ独立行政法人科学技術振興機構

研究成果

浦 聖恵 (Kiyoe Ura)

(corresponding author に*印をしています。)

原著欧文論文

 

  1. Andrea J. Hartlerode, Yinghua Guan, Anbazhagan Rajendran, Kiyoe Ura, Gunnar Schotta, Anyong Xie, Jagesh V. Shah, Ralph Scully Impact of Histone H4 Lysine 20 Methylation on 53BP1 Responses to Chromosomal Double Strand Breaks PLos One 2012 10.1371

  2. KatsunobuKashiwagi, KeisukeNimura,*Kiyoe Ura and *Yasufumi Kaneda.DNA methyltransferase 3b preferentially associates with condensed chromatin.Nucleic Acids Research,39,876-888,2011
  3. Nimura K*. Ura K. and Kaneda Y. Histone methyltransferases: regulation of transcription and contribution to human disease. J. Mol. Med, 88, 1213-1220, 2010
  4. Nim. *Ura K. Shiratori H. Schwartz R. Ikawa M. Okabe M. and *Kaneda Y. A histone H3 lysine 36 trimethyltransferase linkes Nkx2-5 to Wolf-Hirschhorn syndrome. Nature, 460, 287-291, 2009
  5. Yuri S., Fujimura S., NimUra K., Takeda., Toyooka, Y., Fujimura Y., Aburatami H., Ura K., Koseki H., Niwa H. and *Nishinakamura R. Sall4 is essential for stabilization, but not pluripotency, of embryonic stem cells by repressing aberrant trophectoderm gene expression. Stem Cells, 27, 796-805, 2009.
  6. NimUra K., Ishida C., Koriyama H., Hata K., Yamanaka S., Li E., *Ura K and Kaneda Y. Dnmt3a2 targets endogenous Dnmt3L to ES cell chromatin and induces regional DNA methylation. Genes to Cells, 11, 1225-1237, 2006
  7. Takeshima, H., Suetake, I., Shimahara, H., Ura, K., Tate, S. and *Tajima, S. Distinct DNA Methylation Activity of Dnmt3a and Dnmt3b towards Naked and Nucleosomal DNA. J Biochem (Tokyo), 139, 503-515, 2006.
  8. Ishida C, *Ura K., Hirao A., Sasaki H., Toyoda A., Sakaki Y., Niwa H., Li E. and Kaneda Y..Genomic organization and promoter analysis of the Dnmt3b gene, Gene, 310, 153-161, 2003
  9. *Ura K., Araki M., Saeki H., Masutani C., Ito T., Iwai S., Mizukoshi T., Kaneda Y., and Hanaoka F. ATP-dependent chromatin remodeling facilitates nucleotide excision repair of UV-induced DNA lesions in synthetic dinucleosomes. EMBO J. 20, 2004-2014, 2001
  10. *Ura K., and Kaneda Y. Genomic Imprinting : Reconstitution of chromatin in vitro, Methods Mol. Biol., 181. 309-325, 2001
  11. Yamano T., Ura K., Morishita R., Makajima H., Monden M. and *Kaneda Y. Amplification of transgene expression in vitro and in vivo using a novel inhibitor of histone deacetylase, Molecular Therapy, 1, 574-580, 2000
  12. Sato M., Ura K., HohmUra K., Tokumasu F., Yoshimura S., Hanaoka F. and *Takeyasu K. Atomic force microscopy sees nucleosome positioning and histone H1- induced compaction in reconstituted chromatin, FEBS Lett. 452, 267-271, 1999
  13. Ura K., Kurumizaka H., Dimitrov S., Almouzni G. and *Wolffe A.P. Histone acetylation: influence on transcription by RNA polymerase III, nucleosome mobility and positioning, and linker histone dependent transcriptional repression, EMBO J. 16, 2096-2107. 1997
  14. Hayes J.J., Kaplan R., Ura K., Pruss D. and *Wolffe A.P. A Putative DNA Binding Surface in the Globular Domain of a Linker Histone is not Essential for Specific Binding to the Nucleosome, J. Biol. Chem. , 271, 25817-25822, 1996
  15. Ura K., Nightingale K. and *Wolffe A.P. Differential association of HMG-1 and linker histones B4 and H1 with dinucleosomal DNA: structural transitions and transcriptional repression. EMBO J. 15, 4959-4969. 1996
  16. Ura K. and *Wolffe A.P. RNA polymerase and Associated Factors : Reconstitution of Transcriptionally Active and Silent Chromatin, Methods Enzymol., 274, 257-271. 1996
  17. Ura K., Hayes J.J. and *Wolffe A.P. A positive role for nucleosome mobility in the transciptional activity of chromatin templates: restriction by linker histones, EMBO J., 14, 3752-3765. 1995
  18. Ura K, Wolffe A.P. and *Hayes J.J. Core Histone Acetylation Does not Block linker Hitone Binding to a Nucleosme Including a Xenopus borealis 5S rRNA Gene, J. Biol. Chem., 269, 27171-27174, 1994
  19. *Wolffe A.P., Almouzni G., Ura K., Pruss D., Hayes J.J. Transcription factor access to DNA in the nucleosome, Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol., 58, 225-235. 1993
  20. Ura K. and *Hirose S. Possible role of DNA topoisomerase II on transcription of the homeobox gene Hox-2.1 in F9 embryonal carcinoma cells. Nucleic Acids Res., 19, 6087-6092. 1991
  21. Mizutani M., Ura K. and *Hirose S. DNA superhelicity affects the formation of transcription preinitiation complex on eukaryotic genes differently. Nucleic Acids Res., 19, 907-2911. 1991
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欧文総説

  1. *Godde, J.S. and Ura K. Linker Histones and Development. Int. J. Dev. Biol., 53, 215-224, 2009
  2. Godde, J.S. and *Ura K. Cracking the enigmatic linker histone code. J. Biochem. , 143, 287-293, 2008
  3. Ura K. and *Hayes J.J. Nucleotide Excision Repair and Chromatin Remodeling, Review. Eur. J. Biochem. vol. 269, 2288-2293, 2002
  4. *Wolffe A.P., Nightingal K. and Ura K. Nucleosome and Transcription, Nucleic Acid and Molecular Biology. vol. 11, 275-290, 1997
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日本語総説

  1. *浦 聖恵・二村圭祐・金田安史、ヒストンH3K36メチル化による転写制御と疾患、実験医学「細胞核-遺伝情報制御と疾患」Vol. 27, 208-215, 2009, 10月
  2. *二村圭祐・*浦 聖恵・金田安史、ヒストンH3K36トリメチル化酵素WHSC1の異常は転写因子機能障害によって4P-症候群を引き起こす、細胞工学 Vol.28, 2009
  3. *浦 聖恵・金田安史、ヒストンバリアントによるエピジェネティクなクロマチンダイナミクス制御、実験医学「エピジェネティクス医科学」 Vol. 24, 1061-1068, 2006
  4. 浦 聖恵・大隅圭太、リンカーヒストンシャぺロンを用いたクロマチン再構成系、生化学、Vol. 78, 421-425, 2006, 5月
  5. 浦 聖恵、培養細胞からのリンカーヒスとンの精製法、『タンパク質実験マニュアル』胡桃坂 仁志 編、朝倉書店、2006
  6. 佐伯英昭・*浦 聖恵、ヌクレオソームの再構成法とその構造解析法、実験医学別冊、クロマチン・染色体実験プロトコール、84-97, 2004, 6月
  7. *浦 聖恵・森田奈亜子・金田安史、ヌクレオソームの再構成、『細胞核のダイナミクス』竹安 邦夫・米田 悦啓 編、シュプリンガー・フェアラーク東京、2004
  8. *浦 聖恵、クロマチン構造、実験医学別冊、新用語ライブラリー転写因子、90-91, 1999
  9. *浦 聖恵・柏木克信・金田安史、リンカーヒストンによるクロマチンリモデリングの制御、実験医学「クロマチン構造とエピジェネティクス」 Vol. 21, 1413-1418, 2003
  10. 浦 聖恵、再構成クロマチンを用いた修復機構の解析、生化学、Vol. 74, 307-311, 2002, 4月
  11. *浦 聖恵・石田智咲・金田安史、染色体領域のクロマチン構造とヒストンの修飾、実験医学「幹細胞研究の最前線と再生医療への応用」 Vol. 19, 2112-2120, 2000
  12. *浦 聖恵・金田安史、DNAのメチル化とクロマチンを介した転写調節、蛋白質 核酸 酵素、Vol. 45, 1465-1472, 2000
  13. 浦 聖恵、クロマチン構造、実験医学別冊、新用語ライブラリー転写因子、90-91, 1999
  14. *浦 聖恵・胡桃坂仁志、クロマチン構造を介した転写制御、実験医学、Vol. 14, 2560-2567, 1996, 11月
  15. 浦 聖恵、in vitro再構成系を用いたクロマチン構造と転写制御の研究、蛋白質 核酸 酵素、Vol. 41, 1385-1390, 1996,9月
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発表

平成20年度
Gordon Research Conference “Chromatin structure and function”
(5月11-16日)

平成21年度
Gordon Research Conference “Epigenetics”
(8月9-14日)

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講演

平成20年度
7月22日 熊本大学,理学部
7月23日 熊本大学グローバルCOEリエゾンラボ研究会
平成21年度
11月27日 東大先端研ゲノムサイエンス分野セミナー