科学技術振興機構 さきがけ エピジェネティクスの制御と生命機能 エピジェネティクスの制御と生命機能さきがけ独立行政法人科学技術振興機構

研究成果

束田　裕一 （Yuichi Tsukada)

論文

  1. Yu-ichi Tsukada；Hydroxylation mediates chromatin demethylation,The Journal of Biochemistry(2012)151(3):229-246
  2. Tsukada Y.,Nakayama K.:.,In vitro histone demethylase assay.cold spring harbor protocols
    2010 Oct 1;2010(10):
  3. Tsukada. Y.,Ishitani. T.,and Nakayama. K.I.:KDM7 is a dual demethylase for histone H3 LYs 9 and Lys 27 and functions in brain develpoment. GENES & DEVELOPMENT 24:432-437(2010)
  4. Nishiyama, M., Oshikawa, K., Tsukada, Y., Nakagawa, T., Iemura, S., Natsume, T., Fan, Y., Kikuchi, A., Skoultchi, I. A., and Nakayama, K. I.: CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis during early embryogenesis. Nat. Cell Biol. 11: 172-82 (2009).
  5. He J., Kallin M E., Tsukada Y., and Zhang Y. (2008) The H3K36 demethylase Jhdm1b/ Kdm2b regulates cell proliferation and senescence through p15Ink4b. Nat. Struct. Mol. Biol. 15: 1169-75 (2008).
  6. Shirako E., Hirayama N., Tsukada Y., Tanaka T., and Kitamura N. (2008) Up-regulation of p21CIP1 expression mediated by ERK-dependent and -independent pathways contributes to hepatocyte growth factor-induced inhibition of HepG2 hepatoma cell proliferation. J Cell Biochem. 104, 176-88
  7. Maemura, M., Yoshimoto, A., Tsukada, Y., Morishita, Y., Miyazawa, K., Tanaka, T., and Kitamura, N. (2006) Inhibitory effect of mutations in c-Met on the formation of branching tubules by a porcine aortic endothelial cell line. Cancer Sci. 97, 1343-50
  8. Yamane, K., Toumazou, C., Tsukada, Y., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P., Wong, J., and Zhang, Y. (2006) JHDM2A, a JmjC-Containing H3K9 Demethylase, Facilitates Transcription Activation by Androgen Receptor. Cell 125, 483-495
  9. Tsukada, Y., Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y. (2006) Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. Nature (Article) 439, 811-816
  10. Cao, R., Tsukada, Y., and Zhang, Y. (2005) Role of Bmi-1 and Ring1A in H2A ubiquitylation and Hox gene silencing. Mol. Cell 20, 845-854
  11. Han, J., Tsukada, Y., Hara, E., Kitamura, N., and Tanaka, T. (2005) Hepatocyte growth factor induces redistribution of p21ClP1 and p27KlP1 through ERK-dependent p16INK4a up-regulation, leading to cell cycle arrest at G1 in HEPG2 hepatoma cells. J. Biol. Chem. 280, 31548-31556
  12. Tsukada, Y., Tanaka T., Miyazawa, K., and Kitamura, N. (2004) Involvement of down-regulation of Cdk2 activity in hepatocyte growth factor-induced cell cycle arrest at G1 in the human hepatocellular carcinoma cell line HepG2. J. Biochem. (Tokyo) 136, 701-709
  13. Tsukada, Y., Miyazawa, K., and Kitamura, N. (2001) High Intensity ERK Signal Mediates Hepatocyte Growth Factor-induced Proliferation Inhibition of Human Hepatocellular Carcinoma Cell Line HepG2.276, 40968-40976

著書

  1. 束田裕一: クロマチン免疫沈降法 (ChIP). 分子間相互作用解析ハンドブック (羊土社, 東京), 183-188, (2007).
  2. 束田裕一: ヒストンのメチル化と脱メチル化　-脱メチル化を中心に-. 生化学 (日本生化学会), 79: 691-697, (2007).
  3. Tsukada, Y., Zhang, Y.: Purification of histone demethylases from HeLa cells. Methods, 40: 318-326 (2006).
  4. 束田裕一: JmjCドメイン含有タンパク質ファミリーによるヒストンの脱メチル化. 実験医学 (羊土社, 東京), 24: 831-834, (2006).

発表（口頭発表）

  1. FASEB Summer research conferences (Epigenetics, chromatin, and Transcription)
    2009年7月、Colorado USA
  2. IUBMB and FAOBMB Congress
    2006年1月、京都

講演（招待講演）

  1. 束田裕一,: JmjCドメイン含有タンパク質によるヒストンの脱メチル化. 理化学研究所　発生・再生科学総合研究センター, 2007年10月, 神戸
  2. 束田裕一,: JmjCドメイン含有タンパク質によるヒストンの脱メチル化. 千里ライフサイエンスセンター, 2007年10月, 大阪
  3. 束田裕一, Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y.: Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. 三菱化学生命研究所, 2006年6月, 東京
  4. 束田裕一, Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y.: Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. 九州大学, 2006年1月, 福岡
  5. 束田裕一, Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y.: Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. 東京工業大学, 2006年1月, 横浜
  6. 束田裕一, Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y.: Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. 財団法人癌研究会癌研究所, 2006年1月, 東京
  7. 束田裕一, Fang, J., Erdjument-Bromage, H., Warren, ME., Borchers, CH., Tempst, P., and Zhang, Y.: Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins. 東京大学, 2006年1月, 東京