（平成12年度採用研究者：6名）
・「液晶秩序のナノ組織化による高速電気光学効果の発現」／九州大学大学院　菊池　裕嗣
・「強磁場を用いた超微細組織化による耐熱合金の強靭化」／東京工業大学大学院　木村　好里
・「タンパク質表面構造を対象とする認識・変換素子の創製」／九州大学大学院　浜地　格
・「生体膜で働くプロトン駆動のナノマシン」／東京大学　野地　博行
・「遷移金属酸化物の動的構造の実時間測定」／大阪府立大学　森　茂生
・「複数のサブユニットから成るテーラーメイド人工酵素の創製」／京都大学　森井　孝

（平成13年度採用研究者：10名）
・「分子ピラミッドによる機能性ナノ組織体の創出」／名古屋大学大学院　青井　啓吾
・「両親媒性ディスク状化合物の自己組織化とナノデバイスへの応用」／信州大学繊維学部　木村　睦
・「スフィンゴ脂質の自己組織化と細胞機能」／理化学研究所　清川　悦子
・「筋肉タンパク自己組織化ゲルによるソフトナノマシンの創製」 ／北海道大学大学院理学研究科　龔　剣萍
・「ナノ力学理論の開発と力学的制御による表面機能発現」 ／科学技術振興事業団　佐々木　成朗
・「バイオインターフェイスにおいて組織化された水分子の機能」／北海道大学電子科学研究所　田中　賢
・「脂質−膜タンパク質ドメインの制御によるナノプラントの構築」／名古屋工業大学応用化学科　出羽　毅久
・「自己組織化単分子膜を用いたDNAセンサーの構築」 ／理化学研究所　中村　史夫
・「氷内部および界面に存在する気体分子の拡散と組織化」 ／北海道大学低温科学研究所　深澤　倫子
・「無電解めっきのサイズ依存性とナノ光デバイスへの応用」 ／神奈川科学技術アカデミー　物部　秀二

2)「研究内容の紹介」/下記研究課題5テーマの改訂
・「DNA二重らせんを電子機能・構造単位とする単一分子素子」／九州大学　中野　幸二
・「動的高分子ナノ組織体による生体高分子の認識・応答・機能制御」／東京医科歯科大学　秋吉　一成
・「ナノ電極/有機分子組織体による次世代電子素子の創出」／愛媛大学　小川　琢治
・「細胞情報と化学情報を相互変換する分子の創製と機能」／九州大学　片山　佳樹
・「電極表面上での分子集合組織変化−動的機構の解明と機能発現−」／相樂　隆正

3)「研究発表」の追加