【論文・著書】【口頭発表・講演】【特許】【受賞】 |
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DNAを鋳型としたナノファイバーの構造制御 |
岩浦里愛 |
【成果の概要】 |
本研究課題では、相補的核酸塩基対を形成することが可能な自己集合性分子とDNAをナノ構造形成素子として用いることにより、分子認識駆動型のナノファイバー構築と構造制御に挑戦します。さらには、DNAの核酸塩基配列を利用した自己集合性分子の分子配列制御や、ナノファイバーへの光・電子機能の付与を試み、DNA科学と自己集合体科学の融合による新たなナノ構造形成手法と機能を開発します。
1. DNA鋳型により誘起されるチミジル酸−アントラセン複合体1のJ会合体形成
アントラセンの2および6位にスペーサーを介してチミジル酸を導入したチミジル酸−アントラセン複合体1の水中での自己集合および鋳型DNAであるdA20との二成分系自己集合を形成させ、これらの集合体構造や光学特性について検討した。その結果、1とdA20との二成分自己集合体(1-dA20)を含む水溶液についてはUV-Visおよび蛍光スペクトル測定から、アントラセン部位がJ会合していることを示唆する長波長シフトした鋭い極大吸収と、小さなストークスシフトが観察された。また、AFM観察より、1-dA20 の二成分系自己集合体からは高さ5
nmのヘリカルナノファイバーが生成していることが明らかとなった。さらに、自己集合体および二成分系自己集合体について時間分解蛍光スペクトル測定を行ったところ、二成分系自己集合体中のアントラセンは、自己集合体中のアントラセンに比べて蛍光寿命が長寿命化していることがわかった。これは、アントラセン部位が水分子から隔離され無輻射失活が起こりにくくなっていることを示唆する。様々な測定結果から、1-dA20の二成分系自己集合では、アデニン−チミン間の相補的核酸塩基対形成によってらせん構造をもつナノファイバーが生成し、ファイバー中心部のアントラセン部位は短軸方向にhead-to-tail配向することによってJ会合体を形成することがわかった (Figure 1)。
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Figure 1 (a) チミジル酸−アントラセン複合体1と鋳型DNA dA20、およびb) 1-dA20二成分系自己集合体構造とJ会合した1中のアントラセン部位の推定構造。
2. DNAを鋳型とした双頭型ヌクレオチド脂質自己集合体の高次構造形成
炭素数18のオクタデカメチレン鎖両端にチミジル酸をもつ双頭型脂質2とdA20による二成分系自己集合体について詳細に検討した。まず、自己集合体調製直後の2水溶液を偏光顕微鏡で観察した結果、流動性をもつマルテーゼクロスパターンが観察されたことから、2の自己集合体は脂質膜が積層しラメラ液晶となっていることが示された(Figure 2a)。しかし、この流動性とマルテーゼクロスパターンは24時間後には消失し、最終的にはナノファイバーからなるゲルを形成した。一方、二成分系自己集合体2-dA20は長期間流動性を示し、偏光顕微鏡下複屈折が観察された(Figure 2b)。興味深いことに、2-dA20を凍結乾燥した粉末試料のAFM観察を行ったところ、高さ約5 nm、長さ100 nm程度のナノロッドが、ほぼ配向を揃えたネマチック相を形成していた(Figure 2c)。また、このナノロッドを詳細に観察した結果、ピッチ約7 nmの右巻きらせん構造を形成していることがわかった(Figure 2d)。種々の測定から、このナノロッド中では、2のチミンとdA20のアデニンが相補的核酸塩基対を形成しており、ロッド間には負電荷による適度な反発が存在するため凝集を妨げていることが示唆された。すわわち、ネマチック配向の駆動力として、Onsager理論で説明されるロッドの構造相互作用と、ロッド表面の負電荷による反発が考えられる。以上のように、ビルドアップによる分子集合体の階層的な高次構造の構築を達成した。
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Figure 2 (a) 2の自己集合体調製直後および(b) 2-dA20の二成分系自己集合体の偏光顕微鏡像。bar=10μm。(c), (d) 2-dA20の二成分系自己集合体から得られたナノロッドのAFM観察像。
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【論文・著書】【口頭発表・講演】【特許】【受賞】 |
【主な論文・著書】 |
著者 |
岩浦里愛、飯澤智彦、南川博之、亀山眞由美、清水敏美 |
表題 |
Diverse morphologies of self-assemblies from homoditopic 1,18-nucleotide-appended bolaamphiphiles: Effects of nucleobase and complementary oligonucleotide |
発表先 |
Small |
掲載日 |
2010/5/21 |
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著者 |
Rika Iwaura、Mayumi Ohnishi-Kameyama、Tomohiko Iizawa |
表題 |
Construction of helical J-aggregates self-assembled from a thymidylic acid-appended anthracene dye and DNA as a template |
発表先 |
Chemistry - A European Journal |
掲載日 |
2009/4/6 |
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著者 |
岩浦 里愛 |
表題 |
ヌクレオチドナノファイバー |
発表先 |
超分子サイエンス&テクノロジー、エヌ・ティー・エス出版 |
掲載日 |
2009 |
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著者 |
Rika Iwaura、Mayumi Ohnishi-Kameyama、Toshimi Shimizu |
表題 |
Nanofiber formation from sequence-selective DNA-templated self-assembly of a thymidylic acid-appended bolaamphiphile |
発表先 |
Chemical Communications |
掲載日 |
2008/11/28 |
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著者 |
Rika Iwaura、Yoshihiro Kikkawa、Mayumi Ohnishi-Kameyama、Toshimi Shimizu |
表題 |
Effects of OligoDNA Template Length and Sequence on Binary Self-Assembly of a Nucleotide Bolaamphiphile |
発表先 |
Organic and Biomolecular Chemistry |
掲載日 |
2007/11/7 |
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【主な発表・講演】 |
発表者 |
岩浦 里愛(農研機構 食総研 JSTさきがけ)、飯澤 智彦(JST)、南川 博之(産総研)、亀山 眞由美(農研機構)、清水 敏美(産総研) |
表題 |
Effects of nucleobase and complementary oligonucleotide on the self-assembly of 1,18-nucleotide-appended bolaamphiphiles |
発表の場 |
Pacifichem 2010 |
発表日 |
2010/12/19 |
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発表者 |
○岩浦 里愛(農研機構 食総研 JSTさきがけ)、飯澤 智彦(JST)、南川 博之(産総研)、亀山 眞由美(農研機構)、清水 敏美(産総研) |
表題 |
双頭型ヌクレオチド脂質による多様な超分子集合体形成 |
発表の場 |
第59回高分子討論会 |
発表日 |
2010/9/15 |
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発表者 |
岩浦里愛 |
表題 |
DNAを利用したナノファイバー・ナノベシクルの製造 |
発表の場 |
テクノロジーショーケース イン ツクバ 2010 |
発表日 |
2010/1/22 |
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発表者 |
Rika Iwaura , Yuu Someya, Hiroharu Yui, Tomohiko Iizawa, and Mayumi Ohnishi-Kameyama |
表題 |
Formation of Helical J-aggregates Self-Assembled from a Thymidylic Acid-appended Bolaamphiphile and a Template DNA |
発表の場 |
Pacific Polymer Conference 11 |
発表日 |
2009/12/7 |
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発表者 |
Rika Iwaura, Mayumi Ohnishi-Kameyama |
表題 |
DNA-templated self-assembly of molecular building blocks: From biomolecules to functional materials |
発表の場 |
38th UJNR (U.S-Japan Cooperative Program in Natural Resources) |
発表日 |
2009/10/6 |
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発表者 |
飯澤 智彦、岩浦 里愛、南川 博之、亀山 眞由美、清水 敏美 |
表題 |
シチジル酸をもつ双頭型脂質の自発的ベシクル形成 |
発表の場 |
第58回高分子討論会 |
発表日 |
2009/9/17 |
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発表者 |
岩浦 里愛、染谷 悠、由井 宏治、飯澤 智彦、亀山 眞由美 |
表題 |
DNAを鋳型としたヌクレオチド−アントラセン複合体のJ会合体形成と機能 |
発表の場 |
第58回高分子討論会 |
発表日 |
2009/9/18 |
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発表者 |
岩浦 里愛、飯澤 智彦、南川 博之、亀山 眞由美、清水 敏美 |
表題 |
DNAを鋳型としたヌクレオチド脂質の自己集合によるヘリカルロッド形成とネマチック配向 |
発表の場 |
第58回高分子討論会 |
発表日 |
2009/9/17 |
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発表者 |
Rika Iwaura、Mayumi Ohnishi-Kameyama、Toshimi Shimizu |
表題 |
Sequence-selective Quaternary Self-assembly of a Thymidylic Acid-appended Bolaamphiphile and DNA as Templates |
発表の場 |
Hybrid Materials 2009 |
発表日 |
2009/3/17 |
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発表者 |
Rika Iwaura, Mayumi Ohnishi-Kameyama |
表題 |
DNA-templated self-assembly of molecular building blocks: From biomolecules to functional materials |
発表の場 |
38th UJNR (U.S-Japan Cooperative Program in Natural Resources) |
発表日 |
2009/10/6 |
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発表者 |
岩浦 里愛 |
表題 |
DNAを鋳型とした超分子ナノファイバーの創製 |
発表の場 |
筑波大学学際物質科学研究センター第3回機能性分子ミニシンポジウム |
発表日 |
2008/10/25 |
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発表者 |
岩浦 里愛、亀山 眞由美、清水 敏美 |
表題 |
標的オリゴDNAによる超分子ヘリカルナノファイバー形成 |
発表の場 |
第57回高分子討論会 |
発表日 |
2008/9/24 |
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発表者 |
岩浦 里愛 |
表題 |
ヌクレオチド脂質とDNAによるナノファイバーアーキテクトニクス |
発表の場 |
第7回界面ナノアーキテクトニクスワークショップ ナノアーキテクトニクスとイノベーション創出 |
発表日 |
2007/12/13 |
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【特許】 |
発明の
名称 |
ベシクルおよびその製法 |
出願番号 |
特願2009-113707 |
発明者 |
岩浦里愛 |
出願人 |
食品総合研究所、産業技術総合研究所 |
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発明の
名称 |
顕微鏡イメージングにより核酸を検出する方法 |
出願番号 |
2008−102096 |
発明者 |
岩浦里愛、亀山眞由美、清水 敏美 |
出願人 |
食品総合研究所、産業技術総合研究所 |
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【受賞】 |
賞の名称 |
Best Poster Award |
団体機関 |
Singapore National Institute of Chemistry, National University of Singapore |
タイトル |
AFM observations of the binary self-assembly from nucleotide bolaamphiphile and oligonucleotide as templates |
受賞日 |
2007/12/17 |
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