科学技術振興機構 さきがけ エピジェネティクスの制御と生命機能 エピジェネティクスの制御と生命機能さきがけ独立行政法人科学技術振興機構

研究成果

岡本　晃充 （Akimitsu Okamoto)

論文

  1. Nakatani, K.; Okamoto, A.; Yamanuki, M.; Saito, I. Highly efficient synthesis of 2-substituted 4H-chromen-4-ones by means of F--induced 6-endo-digonal cyclization of o-(silyloxy)phenyl ethynyl ketone derivatives. J. Org. Chem. 1994, 59, 4360-4361.
  2. Nakatani, K.; Okamoto, A.; Saito, I. 6-Endo- and 5-exo-digonal cyclizations of o-hydroxyphenyl ethynyl ketones: A key step for highly selective benzopyranone formation. Tetrahedron 1996, 52, 9427-9446.
  3. Nakatani, K.; Okamoto, A.; Okuda, S.; Saito, I. Truncated analogs of kapurimycin A3 and their DNA alkylation mechanism. Nucleic Acids Symp. Ser. 1996, 35, 83-84.
  4. Okamoto, A.; Nakatani, K.; Saito, I. Studies on the mechanism of DNA sequence selective alkylation by kapurimycin A3 analogs. Nucleic Acids Symp. Ser. 1997, 37, 27-28.
  5. Nakatani, K.; Okamoto, A.; Saito, I. Synthesis of ABC ring analog of kapurimycin A3 as an effective DNA alkylating agent. Angew. Chem. 1997, 109, 2881-2884; Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1997, 36, 2794-2797.
  6. Nakatani, K.; Okamoto, A.; Matsuno, T.; Saito, I. Highly selective DNA alkylation at the 5’-side G of a 5’GG3’ sequence by an aglycon model of pluramycin antibiotics through preferential intercalation into the GG step. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 11219-11225.
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  42. Okamoto, A.; Kamei, T.; Tanaka, K.; Saito, I. Electrochemical Behavior of Gold Electrodes Modified with Photosensitizer-tethered DNA. Nucleic Acids Symp. Ser. 2004, 48, 71-72.
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  115. Nomura, A.; Okamoto, A. Photo-Control of DNA Binding of a Zinc Finger Peptide Containing Azobenzene. Peptide Sci. 2009, 2008, 405-406.
  116. Nomura, A.; Tainaka, K.; Okamoto, A. Osmium Complexation of Mismatched DNA: Effect of the Bases Adjacent to Mismatched 5-Methylcytosine. Bioconjugate Chem. 2009, 20 (3), 603-607.
  117. Nomura, A.; Okamoto, A. Photoresponsive Tandem Zinc Finger Peptide. Chem. Commun. 2009, 1906-1908.
  118. Okamoto, A. Synthesis and Use of Osmium-DNA Complexes. J. Synth. Org. Chem. Jpn. 2009, 67 (7), 680-686.
  119. Kubota, T.; Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Yuki, M.; Okamoto, A. Hybridization-Sensitive Fluorescent Probe for Long-Time Monitoring of Intracellular RNA. Bioconjugate Chem. 2009, 20 (6), 1256-1261.
  120. Okamoto, A.; Ikeda, S.; Kubota, T.; Yuki, M.; Yanagisawa, H. Exciton-controlled fluorescence: Application to hybridization-sensitive fluorescent DNA probe. Nucleic Acids Symp. Ser. 2009, 53, 49-50.
  121. Ikeda, S.; Kubota, T.; Yanagisawa, H.; Yuki, M.; Okamoto, A. Synthesis of exciton-controlled fluorescent probes for RNA imaging. Nucleic Acids Symp. Ser. 2009, 53, 155-156.
  122. Nomura, A.; Tainaka, K.; Okamoto, A. Osmium complex binding to mismatched methylcytosine: effect of adjacent bases. Nucleic Acids Symp. Ser. 2009, 53, 207-208.
  123. Ikeda, S.; Kubota, T.; Yuki, M.; Okamoto, A. Exciton-Controlled Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes: Multicolor Detection of Nucleic Acids. Angew. Chem. 2009, 121 (35), 6602-6606; Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48 (35), 6480-6484.
  124. Ikeda, S.; Yuki, M.; Yanagisawa, H.; Okamoto, A. Doubly thiazole orange-labeled cytidine for functional expansion of a hybridization-sensitive probe. Tetrahedron Lett. 2009, 50 (51), 7191-7195.
  125. Ikeda, S.; Kubota, T.; Yuki, M.; Yanagisawa, H.; Tsuruma, S.; Okamoto, A. Hybridization-sensitive fluorescent DNA probe with self-avoidance ability. Org. Biomol. Chem. 2010,8(3),546-551
  126. Lezhava, A.; Ishidao, T.; Ishizu, Y.; Naito, K.; Hanami, T.; Katayama, A.; Kogo, Y.; Soma, T.; Ikeda, S.; Murakami, K.; Nogawa, C.; Itoh, M.; Mitani, Y.; Harbers, M.; Okamoto, A.; Hayashizaki, Y. Exciton-Primer Mediated SNP Detection in SmartAmp2 Reactions. Hum. Mutat. 2010,31(29,208-217.
  127. Yoshida, Y.; Niwa, K.; Yamada, K.; Tokeshi, M.; Baba, Y.; Saito, Y.; Okamoto, A.; Saito, I. A Probe Containing Two Base-discriminating Fluorescent (BDF) Nucleosides for SNP Typing. Chem. Lett. 2010, 39 (2), 116–117.
  128. Nomura, A.; Okamoto, A. Design of a novel methylcytosine-recognition zinc finger peptide. Peptide Sci. 2010, 2009, 345–346.
  129. Okamoto, A. Excitonic interaction: Another photophysical process for fluorescence-controlled nucleic acid sensing. Chem. Rec. 2010, 10 (3), 188–196.
  130. Sets of RNA Repeated Tags and Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes for Distinct Images of RNA in a Living Cell.Takeshi Kubota1, Shuji Ikeda1, Hiroyuki Yanagisawa1, Mizue Yuki1, Akimitsu Okamoto1. PLoS ONE: Research Article, published 27 Sep 2010 10.1371/journal.pone.0013003
  131. Sugizaki, K.; Okamoto, A. ECHO–LNA Conjugates: Hybridization-sensitive Fluorescence and its Application to Fluorescent Detection of Various RNA Strands. Bioconjugate Chem. 2010, 21 (12), 2276–2281.
  132. Nomura, A.; Okamoto, A. Phosphopeptides Designed for 5-Methylcytosine Recognition.Biochemistry 2011, 50(16),pp3376-3385
  133. Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Nakamura, A.; Wang, D. O.; Yuki, M.; Okamoto, A. Hybridization-sensitive fluorescence control in the near-infrared wavelength range Org. Biomol. Chem. 2011, in press.
    (Web:Apr.21,2011)
  134. Sugizaki, K.; Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Okamoto, A. Facile synthesis of hydroxymethylcytosine-containing oligonucleotides and their reactivity upon osmium oxidation. Org. Biomol. Chem. 2011, in press.(Web:Mar.25,2011)
  135. Sugizaki, K.; Umemoto, T.; Okamoto, A. On-chip DNA methylation analysis using osmium complexation. J. Nucleic Acids 2011, in press.

発表

  1. 岡本晃充　「核酸構造をモチーフにした新しい機能素子の創製　-核酸の機能化とナノバイオテクノロジーへの応用-」日本化学会「化学と工業」２月号　「特集　化学のフロンティア2003　-はばたけ若き研究者たち-」pp. 125-128. 平成15年（2003年）2月1日発行
  2. 岡本晃充、齋藤　烈　「DNAを経るホール移動とDNAナノワイヤーの創製」講談社サイエンティフィク「ゲノムケミストリー」「第４章　新機能人工核酸の新しいゲノムケミストリーへの展開」pp. 143-157. 平成15年（2003年）4月10日発行
  3. 岡本晃充　「核酸の機能化とナノバイオテクノロジーへの応用」化学工業社「月刊　化学工業」５月号　「特集　ナノバイオテクノロジーと機能性材料」pp. 1-5. 平成15年（2003年）5月1日発行
  4. 岡本晃充　「塩基識別型蛍光性核酸塩基」日本化学会「生体機能関連化学部会　NEWS LETTER」Vol. 18, No. 3, pp. 6-10. 平成16年（2004年）1月31日発行
  5. 岡本晃充、齋藤　烈　「６章　ナノテクSNP解析」化学同人「化学フロンティア⑬　ナノバイオエンジニアリング」「II部　ナノバイオで解析する」pp. 62-72. 平成16年（2004年）3月31日発行
  6. 岡本晃充　「生体分子の蛍光標識に関する最近の話題」光化学協会「光化学」Vol. 35, No. 1, pp. 48-50. 平成16年（2004年）4月30日発行
  7. 岡本晃充　「塩基識別型蛍光性核酸を用いた遺伝子多型の新判定法」化学工業社「月刊　ケミカルエンジニヤリング」５月号　「特集　ナノバイオテクノロジーの実用化」pp. 29-33. 平成17年（2005年）5月1日発行
  8. 岡本晃充　「DNAメチル化領域にタグを付ける」化学同人「月刊　化学」「2006年注目の論文」pp. 66-67. 平成18年（2006年）1月1日発行
  9. 齋藤義雄、岡本晃充、齋藤　烈　「高精度DNAチップのための塩基識別型蛍光性核酸塩基（BDF塩基）の開発」シーエムシー出版「月刊バイオインダストリー」４月号 平成18年（2006年）4月12日発行
  10. 岡本晃充　「書評：Electrochemistry of Nucleic Acids and Proteins」日本生化学会「月刊　生化学」9月号　pp. 66-67. 平成18年（2006年）9月1日発行
  11. 田中一生、岡本晃充、齋藤　烈　「ホール移動制御を指向した人工核酸塩基群」有機合成化学協会「有機合成化学協会誌」3月号　pp. 204-215. 平成19年（2007年）3月1日発行
  12. 岡本晃充　「20章　微視的環境応答性蛍光核酸」化学同人「化学フロンティア⑱　ゲノム化学」pp. 161-168. 平成19年（2007年）3月31日発行
  13. 岡本晃充　「一塩基多型判定技術の新展開」講談社サイエンティフィク「新しいDNAチップの科学と応用」pp. 127-139. 平成19年（2007年）7月30日発行
  14. 岡本晃充　「微視的環境変化に応答する蛍光色素を利用した1塩基判別」シーエムシー出版「月刊バイオインダストリー」8月号　pp. 51-55. 平成19年（2007年）8月12日発行
  15. 岡本晃充　「有機化学が拓く遺伝子解析の新手法　オスミウムでDNAメチル化を診る」化学同人「月刊　化学」2008 年3月号pp. 12-15. 平成20年（2008年）3月1日発行
  16. 岡本晃充　「Close Up 実験法：ICON法によるDNAメチル化部位の迅速検出法」羊土社「実験医学」2008 年4月号 平成20年（2008年）3月発行
  17. 岡本晃充　「第３章-５　生細胞内mRNAの検出」羊土社「実験医学増刊　生命現象の動的理解を目指すライブイメージング」pp. 176-182. 平成20年（2008年）10月21日発行
  18. 岡本晃充　「オスミウム－DNA錯体の合成と利用」有機合成化学協会「有機合成化学協会誌」7月号　pp. 680-686. 平成21年（2009年）7月1日発行
  19. 岡本晃充、石津有理、Alexander Lezhava　「第2章-3　SNP・変異が目で見えるエキシトンプライマーの開発」オーム社「メディカルバイオ7月別冊　オンサイトDNA診断 個別化医療を可能にする迅速SNP診断技術：SmartAmp法」pp. 46-50. 平成21年（2009年）7月2日発行
  20. 岡本晃充　「講座　生命に係わる化学物質・反応　核酸の化学合成法」日本化学会「化学と教育」7月号　pp. 346-347. 平成21年（2009年）7月20日発行
  21. 岡本晃充　「DNAピリミジン上に形成されるオスミウム錯体」日本化学会「生体機能関連化学部会　NEWS LETTER」平成21年（2009年）9月9日発行

講演（招待講演・受賞講演等に限る）

  1. 日本化学会第82秋季年会（若い世代の特別講演会）　2002年9月25日　大阪大学豊中キャンパス　岡本晃充「核酸構造をモチーフとした新しい機能構造体の創製：機能性DNAワイヤーの構築へ向けて」
  2. 高分子学会九州支部　支部フォーラム　「核酸化学の新展開」　2003年12月19日　九州大学 箱崎理系地区 21世紀交流プラザ　岡本晃充「遺伝子多型の検出のためのインテリジェントな蛍光性人工核酸の開発」
  3. JST異分野研究者交流促進事業ワークショップ　「ゲノムケミストリーの基礎研究からバイオ計測器実用化への異分野交流　-遺伝子診断・治療新技術創製に向けての交流-」　2004年8月6日-8日　群馬県 妙義グリーンホテル　岡本晃充「SNPs検出技術の新展開」
  4. 甲南大学先端生命工学研究所（FIBER）フォーラム2004　2004年12月22日-23日　甲南大学平生記念セミナーハウス　岡本晃充「高機能性人工核酸の合成と遺伝子検出系への展開」
  5. 日本化学会 進歩賞 受賞講演　日本化学会第８５春季年会　2005年3月27日　神奈川大学　岡本晃充「有機化学的手法による高機能核酸の創製とDNAテクノロジーへの展開」
  6. JST SORSTジョイントシンポジウム(4)新鋭研究者からの発信　「クロスオーバーする生命と化学」　2005年11月28日-29日　千里ライフサイエンスセンター　岡本晃充「新遺伝子解析法への化学的アプローチ」
  7. Mini-Symposium on Nucleic Acid Chemistry　2006年2月20日　浦項工科大学（大韓民国)　岡本晃充「Chemical Approach to Efficient Genotyping and Epigenotyping Methods」
  8. 理研セミナー　2006年4月19日　理化学研究所　岡本晃充「化学的アプローチによる遺伝子解析システムの開発」
  9. 第４５回　千里ライフサイエンス技術講習会　「新世代ＤＮＡチップが実現する新たな挑戦」　2006年9月12日　千里ライフサイエンスセンター　岡本晃充「新遺伝子解析法への化学的アプローチ」
  10. JST SORST 齋藤チームシンポジウム　「ゲノム化学の最先端　医学・分子生物学への応用と展開」　2006年9月15日　日本大学　岡本晃充「微視的環境変化に鋭敏に応答する蛍光色素を導入した核酸の機能」
  11. 名古屋大学 21 世紀 COE 「物質科学の拠点形成：分子機能の解明と創造」第3回有機化学若手研究会　2006年12月2日　名古屋大学　岡本晃充「水中での金属反応による核酸の原子選択的機能化」
  12. 学術フロンティア研究　「機能物質創製を目指す化学空間の設計と制御」　公開（国際）シンポジウム　2007年1月27日　神奈川大学　岡本晃充「DNA空間に機能素子を並べる」
  13. 九州大学大学院理学研究院化学部門「化学・材料研究セミナー」　2007年3月16日　九州大学　岡本晃充「核酸周辺の微視的環境変化の追跡に向けた新規蛍光性ヌクレオシドの設計」
  14. 東京大学大学院工学系研究科化学生命工学専攻「化学とバイオの架け橋」　2007年4月7日　東京大学　岡本晃充「遺伝子を診る有機化学」
  15. 第29回日本光医学・光生物学会　2007年7月13日　富山国際会議場　岡本晃充「周辺環境の微視的な誘電率変化をモニターする蛍光性核酸の設計」
  16. 第19回生体機能関連化学若手の会サマースクール　2007年8月7日　八王子セミナーハウス　岡本晃充「有機化学的視点からアプローチする遺伝子解析」
  17. The 1230th Biological Symposium　2008年4月17日　国立遺伝学研究所　岡本晃充「DNAメチル化を検出するための化学反応の紹介」
  18. Royal Society of Chemistry, OBC Lecture Award 2008受賞講演　31st National Medicinal Chemistry Symposium　2008年6月18日　University of Pittsburgh　岡本晃充「DNA-Osmium Complex for DNA Methylation Analysis」
  19. ケミカルバイオロジー研究領域勉強会　2008年7月31日　理化学研究所　岡本晃充「修飾核酸設計：メチル化DNA検出の一例」
  20. 2008 Korea-Japan Symposium on Frontier Photoscience (KJFP 2008)　2008年9月26日　Ramada Hotel in Jeju Island, Korea　岡本晃充「Doubly Thiazole Orange-Labeled Nucleotide: Application to Hybridization-Sensitive DNA Probe」
  21. 基幹研究所発足記念シンポジウム 記念講演　2008年10月22日　東京會舘　岡本晃充「有機化学的遺伝子解析：オリジナルDNAを創る」
  22. 先端生命コロキウム2008　2008年11月12日　東京大学　岡本晃充「化学設計DNAによる核酸簡易解析の一例」
  23. 私立大学戦略的研究基盤形成支援事業「細胞光計測・制御のための新規バイオ技術形成クラスター」講演会　2009年2月25日　慶應義塾大学　岡本晃充「細胞内RNAの可視化技術」
  24. 大阪大学蛋白質研究所セミナー「疾患の基盤としてのエピジェネティクス」　2009年6月29日　大阪大学蛋白質研究所　岡本晃充「メチル化したDNAを高効率検出する新しい化学」
  25. iCeMS Biomaterials at the interface of chemistry, physics, and biology　2009年7月27日　Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, Kyoto　岡本晃充「Excitonic interaction: New photochemical control for nucleic acid imaging」
  26. 14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC 14)　 2009年7月28日　Nagoya Congress Center, Nagoya　岡本晃充「Addition of Osmium to DNA Pyrimidine Bases」
  27. The 13th Asian Chemical Congress　2009年9月14日　Shanghai International Convention Center, China　岡本晃充「Doubly Dye-Labeled Nucleotide: Toward Efficient RNA Imaging」
  28. 東京大学大学院工学系研究科化学生命工学専攻「化学と生命のかけはし」　2009年9月28日　東京大学　岡本晃充「効果的な核酸イメージングのための新たな光有機化学的しかけ」
  29. BIT 2nd Annual Congress and Expo of Molecular Diagnostics (CEMD-2009)　2009年11月21日　Beijing International Convention Center, China　岡本晃充「ICON probe: Osmium complexation for pinpoint detection of methylated cytosines」
  30. 名古屋市立大学大学院薬学研究科大学院講義「センサー・デバイス開発学」　2009年12月3日　名古屋市立大学　岡本晃充「人工核酸：核酸の効率的センシングのための分子設計」