科学技術振興機構（ＪＳＴ）、医薬基盤研究所（ＮＩＢＩＯ）、農業生物資源研究所（ＮＩＡＳ）、産業技術総合研究所（ＡＩＳＴ）は、内閣府総合科学技術会議の議論を受けて平成２３年１２月１２日（月）に文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産業省が取り組む生命科学系データベースの統合化の方針や成果を紹介する合同ポータルサイト「ｉｎｔｅｇｂｉｏ．ｊｐ」（インテグバイオ）を共同で開設しました。
生命科学におけるデータベースは、例えばｉＰＳ細胞作製の成功には遺伝子データベースの情報が不可欠であったように、研究のインフラとして世界中で活発に開発、利用されています。その結果、現在では多数のデータベースが乱立しており、それを使いやすくするための統合化が重要な課題となっています。日本でも、生命科学に関係した各省で統合化に向けた取り組みが平成１８年頃から始まりました。当初は各省で独自に進めていたデータベースの統合化をオールジャパンの体制で進めるために、内閣府の主導のもと各省の協力体制を構築して、平成２３年度からは４つのステップ（カタログ、横断検索、アーカイブ、再構築）に沿って進めています。
最初のステップ「カタログ」は、データベース単位のリンク集です。しかしリンクだけでは、ユーザーはデータベースごとに検索しなければなりません。「横断検索」は、複数のデータベースの中身を一括してキーワード検索するものです。これにより、ユーザーは１つの窓口から入ってデータベースを検索できるようになります。「アーカイブ」は、データベースのフォーマットの統一と権利関係の整理などにより、データベースのダウンロードと再利用を可能にするものです。「再構築」は、複数のデータベースが有機的に組み合わされることによって、「横断検索」よりもさらに高度な検索、例えば「ヒトのあるタンパク質に結合する低分子を花粉に含む植物」のような検索をユーザーが行えるものです。この「再構築」では、情報技術や計算機資源、データを整理する手間などの問題に加えて、データベースを改変する権限の有無も問題となるため、これらを１つずつ解決していく必要があります。
合同ポータルサイトでは、４省が協調・連携して取り組んでいる「カタログ」、「横断検索」、「アーカイブ」の方針と成果についてまとめています。また、データベースの統合化に関するシンポジウムや講習会、展示会の情報を発信して、この取り組みに対する研究コミュニティーの関心や理解が深まるよう努めていきます。これにより、今まで４省で独自に進められてきたデータベースへの取り組みが１つにまとまり促進されると期待されます。
ポータルサイトＵＲＬ：http://integbio.jp/
