戦略的創造事業本部は、研究推進部、特別プロジェクト推進室、研究支援部および研究企画調整室から構成されており、研究事務所と連携を取りながら業務を行います。

研究領域毎に研究事務所を設置し、研究の日常的な活動をサポートします。

研究事務所には、研究計画の調整、研究進捗状況の把握、外部発表の手続き等の業務を行う技術参事、設備や材料の購入、物品管理、出張手続き等の業務を行う事務参事および事務員が常勤し、研究総括の元で研究支援を行います。