光・量子

1. 先端光源を駆使した光科学・光技術の融合展開 [ 領域HP ]
2. 新機能創成に向けた光・光量子科学技術 [ 領域HP ]

ライフサイエンス

1. 生体恒常性維持・変容・破綻機構のネットワーク的理解に基づく最適医療実現のための技術創出
2. ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術
3. 生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出
4. エピゲノム研究に基づく診断・治療へ向けた新技術の創出
5. 炎症の慢性化機構の解明と制御に向けた基盤技術の創出 [ 領域HP ]
6. 脳神経回路の形成・動作原理の解明と制御技術の創出 [ 領域HP ]
7. 人工多能性幹細胞（iPS細胞）作製・制御等の医療基盤技術 [ 領域HP ]
8. アレルギー疾患・自己免疫疾患などの発症機構と治療技術 [ 領域HP ]
9. 精神・神経疾患の分子病態理解に基づく診断・治療へ向けた新技術の創出 [ 領域HP ]
10. 生命システムの動作原理と基盤技術 [ 領域HP ]
11. 代謝調節機構解析に基づく細胞機能制御基盤技術 [ 領域HP ]

情報・計算科学

1. ポストペタスケール高性能計算に資するシステムソフトウェア技術の創出 [ 領域HP ]
2. 共生社会に向けた人間調和型情報技術の構築 [ 領域HP ]
3. 数学と諸分野の協働によるブレークスルーの探索 [ 領域HP ]
4. ディペンダブルVLSIシステムの基盤技術 [ 領域HP ]
5. 実用化を目指した組込みシステム用ディペンダブル・オペレーティングシステム [ 領域HP ]
6. 先進的統合センシング技術 [ 領域HP ]
7. 情報システムの超低消費電力化を目指した技術革新と統合化技術 [ 領域HP ]
8. マルチスケール・マルチフィジックス現象の統合シミュレーション [ 領域HP ]

ナノテク・材料

1. 新機能創出を目指した分子技術の構築
2. 元素戦略を基軸とする物質・材料の革新的機能の創出 [ 領域HP ]
3. プロセスインテグレーションによる機能発現ナノシステムの創製 [ 領域HP ]
4. プロセスインテグレーションに向けた高機能ナノ構造体の創出 [ 領域HP ]
5. 次世代エレクトロニクスデバイスの創出に資する革新材料・プロセス研究 [ 領域HP ]
6. ナノ科学を基盤とした革新的製造技術の創成 [ 領域HP ]
7. ナノ界面技術の基盤構築 [ 領域HP ]

環境・エネルギー

1. 分散協調型エネルギー管理システム構築のための理論及び基盤技術の創出と融合展開
2. エネルギー高効率利用のための相界面科学
3. 二酸化炭素資源化を目指した植物の物質生産力強化と生産物活用のための基盤技術の創出 [ 領域HP ]
4. 海洋生物多様性および生態系の保全・再生に資する基盤技術の創出
5. 藻類・水圏微生物の機能解明と制御によるバイオエネルギー創成のための基盤技術の創出 [ 領域HP ]
6. 太陽光を利用した独創的クリーンエネルギー生成技術の創出 [ 領域HP ]
7. 持続可能な水利用を実現する革新的な技術とシステム [ 領域HP ]
8. 二酸化炭素排出抑制に資する革新的技術の創出 [ 領域HP ]